Žemę ištiko baisi ekologinė katastrofa. Nemaža dalis plotų pavirto pelkynais, kuriuose veisiasi keisti padarai, o oras ir augmenija ten tapo nuodingais. Nausikajai teks nelengva užduotis atrasti "priešnuodį" prieš planuojamą naująjį tautų karą. Galbūt, jai pavyks pakeisti pasaulio...
Kai užsispyręs gatvės našlaitis Seija, ieškodamas pagrobtos sesers, netyčia pasinaudoja paslėptomis jėgomis, jis atranda, kad gali būti vienintelis gyvas žmogus, galintis apsaugoti reinkarnuotą deivę, pasiųstą prižiūrėti žmonijos. Ar jis gali paleisti savo praeitį ir priimti savo...
Kenšino praeitis jį užklumpa ir tampa užeigos „Akabeko“ sunaikinimo priežastimi, kuri buvo mėgstamiausia Kenšino valgymo vieta. Ten jis randa raštelį su ant jo parašytu žodžiu „Junchu“.
"Rurouni Kenšinas" pasakoja apie klajoklį Kenšiną Himurą, besinešiojantį kardą atbulais ašmenimis – simbolį priesaikos, jog daugiau nieko nebežudys. O priežastis tam yra, kadangi šis veikėjas per revoliuciją buvo žinomas Hitokiri Batusai vardu. Per karą Batusai buvo...
Vieną dieną judrioje gatvėje mergaitė Haru drąsiai išgelbėja nuo mirties po automobilio ratais žavingą katiną. Ji be galo nustemba, kai katinas atsistoja ant užpakalinių letenų ir padėkoja Haru žmonių kalba. Vėliau paaiškėja, kad šis katinas yra paslaptingos Kačių karalystės...