Praėjus dvejiems metams po to, kai keturi bebaimiai kovotojai Mikelandželas, Donatelas, Leonardas ir Rafaelis nugalėjo piktadarį Šrėderį ir atnešė taiką bei ramybę Niujorkui, įtampa mieste vėl ima didėti. Užuosdami kažką negero, vėžliukai ima aiškintis situaciją ir atranda, kad...
Vidury Pietų Kinijos jūros po vandeniu driekiasi didžiulių kalnų virtinė. Kalnai tokie aukšti, kad jų giliuose tarpekliuose tilptų Himalajai. Taip giliai dar nėra pabuvojęs nė vienas žmogus… Jau ištisus šimtmečius Pietų Kinijos jūroje paslaptingai be pėdsako dingsta...