Po įvykių antrojoje Beždžionių planetos dalyje, Kornelijus ir Zira pabėga atgal per laiką į Žemę, į 20-ojo amžiaus Los Andželą, kur jie susiduria su baime ir persekiojimu, panašiai kaip tai patyrė ateityje beždžionių planetoje Tayloras su Brentu ir atranda įvykių kilmės...
Veiksmas vyksta 1962 metais, per patį Karibų krizės įkarštį. Aukštas sovietų žvalgybos pareigūnas perbėga į JAV. Jis praneša, kad SSSR ir Kuba pasirašė slaptą sutartį dėl bendradarbiavimo karinėje srityje. Tačiau išsiaiškinti, kas dedasi saloje, nelengva. Todėl žvalgybos...
