Tolimoje žmonijos ateityje, Geležinio miesto metalo laužo supirktuvėje likimo valiai paliktą Alitą suranda Ido – kibernetikos daktaras. Alita ne tik nepamena, kas ji tokia, bet ir neturi jokio suvokimo apie ją supantį pasaulį. Viskas Alitai yra nauja, kiekviena patirtis yra pirmoji...
Didžiausių pasaulyje slaptųjų agentų vaikai nesąmoningai padeda galingam žaidimų kūrėjui išlaisvinti kompiuterinį virusą, suteikiantį jam galimybę valdyti visas technologijas, todėl jie patys tampa šnipais, kad išgelbėtų savo tėvus ir pasaulį.